Séance 5: Visualisation et matériel
Jeudi 2018-11-15 09:00-11:00.
Cafétéria, Pavillon Alphonse-Desjardins
- Retour sur les lectures
- Le format SAM
- Mesurer le temps: time et /usr/bin/time
- Écriture d'un script pour aligner les séquences sur une référence
- Visualisation d'alignements avec samtools tview
- Visualisation d'alignements avec Tablet
pause
- Avoir plusieurs terminaux: tmux
- Matériel: lspci, lsusb, lshw
- Tous les processus: /proc
- Processeur et mémoire: /proc/cpuinfo, /proc/meminfo
- Journal du noyau Linux: dmesg
- Système: /sys
- Modules du noyau Linux: lsmod
- Réseau: ifconfig, netcat
Voici les lectures pertinentes pour cette semaine:
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